常检查的是T3、T4、FT3、TF4和TSH。T3、T4是甲状腺分泌的甲状腺素，它们可以与血清中的蛋白质结合，但要发挥作用，它们必须与血液中的蛋白质分开，因此游离甲状腺素的测量FT3、FT更能反映甲状腺的功能。TSH它是大脑垂体分泌的促甲状腺激素。它就像大脑派出的调度员来调节甲状腺的工作。如果体内甲状腺素较少，则为甲状腺功能减退，TSH上升，促进甲状腺产生更多的甲状腺素；相反，甲亢患者体内甲状腺素过多，因此TSH会减低。尹志强，上海第十人民医院甲状腺疾病诊疗中心

例如，一些抗体指标TPO-Ab、TG-Ab和TR-Ab。甲状腺慢性炎症患者需要检查TPO-Ab和TG-Ab，因为这两个指标反映了患者的炎症状态，有时经过一段时间的治疗，这两个指标可能会下降，但通常不会下降到正常状态。疑似甲状腺机能亢进的患者也需要检查TR-Ab，异常增加可提示原发性甲状腺机能亢进。

除上述8个指标外，有时医生还会向不同的患者开放降钙素、甲状腺球蛋白、甲状旁腺素对于其他指标，具体指标的情况分析具体指标的意义。