高位复杂性肛瘘，是杨巍的主攻方向。人体的直肠和肛管之间有一圈锯齿形的环形线，称为齿状线。此处的直肠黏膜间形成的许多开口向上的漏斗状小窝，称为肛隐窝。如果一个人肠胃功能不佳，大便稀薄、经常腹泻，“一些脏东西”就会积在肛隐窝中。再加上工作压力大、生活不规律、熬夜等引起的免疫力下降，人体内的这个肛隐窝极易发生细菌感染，形成肛周脓肿。肛周脓肿破溃后，就会形成肛瘘。这种疾病的手术难度较大，是国内外公认的疑难杂症。肛瘘根据数量和位置，有单纯性和复杂性、低位和高位之分。如果脓肿炎症蔓延、扩展，形成多个脓腔，遗留2个及以上的内外口和瘘管，称为复杂性肛瘘。而高位复杂性肛瘘位于肛管直肠环上方，瘘管数量多，复杂弯曲，约占肛瘘的10%，较难治。相较普通肛瘘，高位复杂性肛瘘的治疗难度又有所上升，杨巍迎难而上，将其作为主攻目标。
结合中西医，创制了一套能显著降低复发率、减轻并发症、缩短治疗周期、降低患者痛苦的特色肛瘘疗法。术前分两步走。第。一步，以中药为患者调理肠胃，创造“时机”。她认为，肛瘘由湿热下注大肠、蕴阻肛门、气血凝滞所致，中药通过整体与局部相结合的辨证治疗达到清利湿热毒邪、调畅气血的效果，完成消散炎症、减轻临床症状的目的，为手术创造良好条件。第二步，再以西医放射科、影像学检查为辅助，精准“侦查”情况。杨巍认为，单靠肉眼观察和手摸，较难精准定位疾病的“根”在何处。因此，她们和放射科组成诊治小组，深入挖掘肛瘘内口的位置、到肛门的距离、支管数量等临床关键参数，为手术提供便利条件。她还创新研发了“对口切开旷置垫棉结合高位松挂线术”，能有效避免切开肛门括约肌而引起的肛门失禁等并发症、保护肛门、直肠的正常形态和功能。杨巍还非常重视患者术后的创面管理，有一套多年行之有效的经验方——“促愈熏洗方”。该方子为坐浴制剂，能降低疾病复发率，减少术后并发症。
“实炎方”治疗溃疡性结肠炎。溃疡性结肠炎古称“肠澼”“痢疾”，杨巍认为这种病虽然发于肠，但同肝脾肾三脏关系密切，发病机理为“湿热客肠，乘虚而发”，应采用“清热燥湿、培元固本”的治疗原则。创制了以“祛湿”为主的“实炎方”，以三黄（黄芩、黄连、黄柏）加痛泻药方加参苓白术散加减而成。三黄同用，清热燥湿力强。黄芩主要是清肺热，“肺与大肠相表里”，肺热得除，肺气宣发，自然利于大肠的传导。黄连为治痢之较，长于清肠道的湿热。黄柏“主五脏肠胃中结热”。痛泻要方以疏肝理气健脾。此外，大量苦寒药物伤脾碍胃，故予参苓白术散健脾。
“熏洗方”促创口愈合。疼痛、肛缘水肿、创面出血、渗液、瘙痒等是痔手术后的常见并发症，影响患者术后康复，也是肛肠治疗面临的棘手难题。“促愈熏洗方”由虎杖、蒲公英、苦参、五倍子、当归组成。方中，虎杖清热解毒、活血通络，煎汁外洗有收敛、消炎作用。蒲公英可解毒消肿、消毒杀菌、生肌收口。苦参清热燥湿，其提取物具有杀灭各种细菌的作用。五倍子解毒消肿、收湿敛疮。当归活血散瘀，改善溃疡创面血液循环，加快代谢产物的清除。
“肛痈方”治疗肛周脓肿。肛周脓肿的疼痛和成脓，中医辨证为经络气血瘀滞，湿热蕴结于肛门。疼痛以气血瘀滞为主，脓肿则为气血瘀滞、热胜肉腐所致。“肛痈方”是曙光医院肛肠科行效临床20年的经验方，以水牛角片为君，生地、山栀、黄芩、黄柏共达清热之效；黄芪为臣，因脓为气血所化生，必耗气伤血，黄芪乃“疮家圣药”，加上丹皮、赤芍、当归改善血液循环，增加组织供血；皂角刺、制甲片为佐，软坚散结；川萆薢为使，引药直达病所。全方攻防兼备，适用于肛痈３期。
