跑步时肚子疼可能是跑步达到一定程度到了生理上的运动极限；可能是跑步之前未做好热身运动，跑步的时候牵拉腹部神经引起的痉挛性疼痛；也有可能是腹部的器质性病变。患者可以先对疼痛的部位和程度进行判断，然后再选择合适的科室就诊。跑步肚子疼可以挂的科室通常有以下一些：
1、急诊科：如果疼痛非常剧烈，应该挂急诊科。
2、消化内科：如果是上腹部、脐周疼痛，则有可能是急慢性肠胃炎，挂消化内科。
3、外科：如果是右下腹疼痛，则有可能是阑尾炎，可以挂外科。
4、妇科：如果是育龄期女性出现剧烈运动后的一侧腹部或者下腹部出现剧烈疼痛，可能是卵巢囊肿蒂扭转，要到妇科就诊，及时进行治疗。
5、泌尿外科：如果肚脐左右侧疼痛比较明显，伴有排尿不畅，甚至尿液偏红，出现血尿，可能是输尿管结石，建议挂泌尿外科。
6、内科：如果无法确定原因，可以先挂内科，由内科医生进行评估分诊。
