引起结肠炎的因素很多，任何一种胃肠疾病的诱发因素都不是单一的。许多医学学者认为结肠炎是一种自身免疫性疾病。由于该病存在多种自身免疫性疾病，肾上腺皮质激素可缓解病情，部分患者血清中可发现抗结肠上皮细胞抗体，因此认为该病的发生可能与自身免疫反应有关。其次是感染因素。结肠炎的病理变化和临床表现与某些结肠感染性疾病相似，所以有人认为感染是本病的病因。在细菌、真菌、病菌等各种因素中，目前的研究表明病菌的可能性更大。
除了以上两种原因，遗传和神经因素也是结肠炎的主要原因。众所周知，有些胃肠疾病是遗传的，在血缘家庭中结肠炎的发病率很高。据欧美文献统计，溃疡性结肠炎患者的直系血亲中，该病的发生可能与遗传因素有关。
精神因素在结肠炎的发病中也起着决定性的作用，心身疾病强调心理因素在疾病的发生或病程中起重要作用。
结肠炎的病因建议每个患者都要了解清楚，以免结肠炎伤害患者身体，造成没发治好的后果；另外，结肠炎患者不仅要了解病因进行治疗，还要做好护理措施，防止结肠炎对你的身体造成伤害。
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